Home
Classes
Methods
Defined In
lib/miga/cli/base.rb
Pages
README
Class and Module Index
File
MiGA
MiGA::Cli
MiGA::Cli::Action
MiGA::Cli::Action::About
MiGA::Cli::Action::Add
MiGA::Cli::Action::AddResult
MiGA::Cli::Action::Archive
MiGA::Cli::Action::ClassifyWf
MiGA::Cli::Action::Console
MiGA::Cli::Action::Daemon
MiGA::Cli::Action::Date
MiGA::Cli::Action::Db
MiGA::Cli::Action::DerepWf
MiGA::Cli::Action::Doctor
MiGA::Cli::Action::Doctor::Base
MiGA::Cli::Action::Doctor::Databases
MiGA::Cli::Action::Doctor::Distances
MiGA::Cli::Action::Doctor::Operations
MiGA::Cli::Action::Download
MiGA::Cli::Action::Download::Base
MiGA::Cli::Action::Download::Gtdb
MiGA::Cli::Action::Download::Ncbi
MiGA::Cli::Action::Download::Seqcode
MiGA::Cli::Action::Edit
MiGA::Cli::Action::Env
MiGA::Cli::Action::Files
MiGA::Cli::Action::Find
MiGA::Cli::Action::Generic
MiGA::Cli::Action::Get
MiGA::Cli::Action::GtdbGet
MiGA::Cli::Action::IndexWf
MiGA::Cli::Action::Init
MiGA::Cli::Action::Init::DaemonHelper
MiGA::Cli::Action::Init::FilesHelper
MiGA::Cli::Action::Lair
MiGA::Cli::Action::Ln
MiGA::Cli::Action::Ls
MiGA::Cli::Action::NcbiGet
MiGA::Cli::Action::New
MiGA::Cli::Action::NextStep
MiGA::Cli::Action::Option
MiGA::Cli::Action::PreprocWf
MiGA::Cli::Action::QualityWf
MiGA::Cli::Action::Rm
MiGA::Cli::Action::Run
MiGA::Cli::Action::SeqcodeGet
MiGA::Cli::Action::Stats
MiGA::Cli::Action::Summary
MiGA::Cli::Action::TaxDist
MiGA::Cli::Action::TaxIndex
MiGA::Cli::Action::TaxSet
MiGA::Cli::Action::TaxTest
MiGA::Cli::Action::Touch
MiGA::Cli::Action::Wf
MiGA::Cli::Base
MiGA::Cli::ObjectsHelper
MiGA::Cli::OptHelper
MiGA::Common
MiGA::Common::Format
MiGA::Common::Hooks
MiGA::Common::Net
MiGA::Common::Path
MiGA::Common::SystemCall
MiGA::Common::WithDaemon
MiGA::Common::WithDaemonClass
MiGA::Common::WithOption
MiGA::Common::WithResult
MiGA::Daemon
MiGA::Daemon::Base
MiGA::Dataset
MiGA::Dataset::Base
MiGA::Dataset::Hooks
MiGA::Dataset::Result
MiGA::Dataset::Result::Add
MiGA::Dataset::Result::Ignore
MiGA::Dataset::Status
MiGA::Dataset::Type
MiGA::Error
MiGA::Json
MiGA::Lair
MiGA::Metadata
MiGA::MiGA
MiGA::Parallel
MiGA::Project
MiGA::Project::Base
MiGA::Project::Base::Float
MiGA::Project::Dataset
MiGA::Project::Hooks
MiGA::Project::Result
MiGA::RemoteDataError
MiGA::RemoteDataMissingError
MiGA::Result
MiGA::Result::Base
MiGA::Result::Dates
MiGA::Result::Source
MiGA::Result::Stats
MiGA::Result::Versions
MiGA::SQLite
MiGA::SystemCallError
MiGA::TaxDist
MiGA::TaxIndex
MiGA::TaxIndexTaxon
MiGA::Taxonomy
MiGA::Taxonomy::Base
Net
String
module MiGA::Cli::Base
frozen_string_literal: true